Organellen eukaryotischer Zellen, die vor allem für die Versorgung mit ATP verantwortlich sind.

Wie in der Abbildung dargestellt, existieren die Mitochondrien als mehr oder weniger ovale Körper im Cytosol. Mitochondrien beherbergen Stoffwechselwege zum Abbau von Fettsäuren und zur abschließenden Oxidation aktivierter Essigsäurereste (Citratzyklus und Atmungskette). Sie sind deswegen die wichtigsten Produzenten von ATP und werden auch als "Kraftwerke der Zelle" bezeichnet. Wie im unteren Teil der Abbildung dargestellt, besitzen Mitochondrien eine innere und äußere Membran. Die innere Membran ist auf vielfältige Weise gefaltet und beherbergt die Atmungskette.

Mitochondrien enthalten die Gene für einige ihrer Proteine, sowie die enzymatische Ausstattung, diese Gene abzulesen. Diese Beobachtung deutet darauf hin, dass die Organellen sich über eine Endosymbiose aus ursprünglich selbständigen, Bakterien entwickelten.