Eine der drei großen Organismengruppen (neben Eukaryoten und Archaeen), die sich im Verlauf der Evolution bildeten.

Bakterien sind Mikroorganismen mit ähnlichen äußeren Merkmalen wie die Archaeen (einfache Zellen ohne Kern oder Organellen). Deswegen werden sie gemeinsam mit ihnen als Prokaryoten bezeichnet.

Einige Organellen der im Gegensatz zu den Prokaryoten komplexer gebauten Eukaryoten (insbesondere Mitochondrien und Chloroplasten) entstanden durch Endosymbiosen bestimmter Bakterien mit Vorläufern der Eukaryoten.