Die Strukturformel für ein Molekül repräsentiert die räumliche Anordnung seiner Atome und die Art und Weise ihrer Verknüpfung. (Jeder Strich markiert ein Elektronenpaar der äußeren Schalen der Elektronenhülle. Striche zwischen einzelnen Atomen entsprechen kovalenten Bindungen, Striche an einzelnen Atomen freien Elektronenpaaren.)
Im Beispiel ist die Strukturformel des Acetaldehyds dargestellt. Alle schwarz markierten Atome und Bindungen liegen innerhalb der (grau markierten) Zeichenebene. Lediglich die beiden rot markierten Wasserstoffatome liegen außerhalb dieser Ebene. Dabei führen punktierte Bindungen hinter die Zeichenebene, verdickte Bindungen vor die Zeichenebene. Die freie Drehbarkeit der Bindung zwischen den beiden Kohlenstoffatomen ist durch den blauen Pfeil gekennzeichnet, die Teilladungen des Kohlenstoff- und Sauerstoffatoms durch die entsprechenden rot markierten Symbole.